آیت الله حسین نوری همدانی از مراجع تقلید در پیامی با تسلیت شهادت محسن فخری زاده از دانشمندان هسته ای کشور گفت: مسئولان با جدیت این موضوع را پیگیری و عاملان این جنایت را به سزای عمل خود برسانند و راه را برای کسانی که دل درگرو غرب دارند ببندند.
اتحادیه اروپا با صدور بیانیه‌ای ترور دانشمند برجسته ایرانی را اقدامی مجرمانه و در تضاد با اصول حقوق بشر دانست.
علی مطهری در واکنش به ترور دانشمند ایرانی در توئیتی نوشت: انتقام از نتانیاهو و قصاص ترامپ را به زمان مناسب موکول کنیم.
پس از ترور دانشمند هسته‌ای ایرانی، تلویزیون رژیم صهیونیستی خبر داد که این رژیم سطح آماده‌باش نیروهای خود در تمام سفارتخانه‌هایش را بالا برده است.
خبرگزاری رویترز گزارش داد که ایران با ارسال یک پیام مکتوب به شورای امنیت سازمان ملل تاکید کرده است که نشانه‌های جدی وجود دارد که اسرائیل مسئول ترور محسن فخری زاده دانشمند هسته‌ای ایران است.
یک مقام آمریکایی در مصاحبه با شبکه سی ان ان گفت که واشنگتن از نزدیک در حال بررسی ادعای ترور دانشمند برجسته هسته ای ایران است.
رژیم صهیونیستی از سال‌ها پیش برنامه‌ای را برای ترور دانشمندان هسته‌ای ایران آغاز کرده و به دنبال ترور شهید محسن فخری‌زاده بود.
دبیر کل سازمان ملل در واکنش به ترور دانشمند هسته‌ای ایران از همه طرفها خواست از افزایش تنش‌ها خودداری کنند!
معاون دبیر کل حزب الله شهادت دانشمند هسته‌ای ایران را بخشی از جنگ علیه آزادگان منطقه توصیف کرد.
وزیر کشور و رئیس شورای امنیت کشور با صدور پیامی گفت: شهید فخری زاده و سایر شهدای بزرگوار دانش هسته ای و دیگر علوم پیشرفته همانند سردار دلها شهید حاج قاسم سلیمانی گواهان صادقی بر پیشرفت و قدرت علمی و اقتدار و صلابت دفاعی انقلاب اسلامی هستند.